Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms