Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms