Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms