Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms