Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBPF3Q9H094 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms