Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ASXL3Q9C0F0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASXL3Q9C0F0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms