Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZYG11BQ9C0D3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms