Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AMBRA1Q9C0C7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AMBRA1Q9C0C7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms