Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CIPCQ9C0C6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms