Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT23Q9C075 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms