Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms