Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms