Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT17Q9BSW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms