Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms