Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms