Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP19Q99542 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms