Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP2Q96SN8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP2Q96SN8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms