Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms