Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC3BQ96NL0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms