Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EP400Q96L91 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms