Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms