Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DCHS1Q96JQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms