Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms