Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A4Q96EP9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms