Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC59Q96AG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC59Q96AG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms