Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTSSAQ969W0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms