Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms