Protein–RNA interactions for Protein: Q92988

DLX4, Homeobox protein DLX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLX4Q92988 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DLX4Q92988 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DLX4Q92988 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms