Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRG4Q92954 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms