Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms