Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX92

NELFB, Negative elongation factor B, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFBQ8WX92 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFBQ8WX92 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFBQ8WX92 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms