Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GIPC3Q8TF64 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms