Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3IP1Q8TDR0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms