Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF1Q8ND25 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms