Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH13Q8NBN7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms