Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms