Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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CLDN19Q8N6F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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CLDN19Q8N6F1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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CLDN19Q8N6F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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