Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM20Q8N5G0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM20Q8N5G0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM20Q8N5G0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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