Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C17orf53Q8N3J3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms