Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC2Q8N394 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC2Q8N394 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms