Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CA13Q8N1Q1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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