Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HACE1Q8IYU2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms