Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms