Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
STRCQ7RTU9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms