Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH2Q76I76 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms