Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms