Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms