Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETMD1Q6P1Q0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms