Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LCN8Q6JVE9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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LCN8Q6JVE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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LCN8Q6JVE9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN8Q6JVE9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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