Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAPH2Q6IBW4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms